Если покупатель в 2019 году (до даты отгрузки) дополнительно к предоплате, перечисленной до 1 января 2019 года, доплачивает продавцу сумму НДС в размере 2% в связи с изменением ставки НДС с 18 до 20%, то такую доплату следует рассматривать в качестве доплаты суммы налога.
В этом случае продавец должен выставить корректировочный счет-фактуру на разницу между показателем суммы НДС по счету-фактуре, составленному ранее с применением ставки 18/118, и показателем суммы налога, рассчитанной с учетом размера доплаты налога.
Минфин России разъяснил, что доплаченную сумму НДС покупатель может принять к вычету на основании корректировочного счета-фактуры, выставленного продавцом.